与此同时,孟山都还在该公司应该为其转基因棉花种子收取多少费用的问题上与印度政府之间存在纠纷,这个问题使其每年面临着数千万美元的营收损失。这项史无前例的撤回申请的决定可能会导致孟山都推出采用所谓“Bollgard II Roundup Ready Flex”技术的新型转基因棉花种子的计划被迫推迟几年时间,并导致其进一步蒙受亏损。
孟山都在印度市场上的合作伙伴Maharashtra Hybrid Seeds Co Ltd.在7月5日发出的一封信函中特别提到了政府在5月份提出的这项计划,内容是要求孟山都共享其专有技术。在受到孟山都及其他全球种子公司的抗议后,印度政府暂时撤回了这项命令,并决定寻求来自于利益相关者的信息反馈,目前则正在对这些反馈信息进行评估。