尽管生物法得到了很大发展，但随着染料废水的可生化度降低，受到微生物对营养物质、pH值、温度等条件有苛刻要求的限制，在实际应用处理染料废水时，生物法很难适应染料废水水质波动大、染料种类多、毒性高的实际状况。如微生物的高效化及固定化等生物强化技术。许多专家和学者都致力于高效降解菌的筛选和基因工程菌的构建等研究工作，实现利用大自然现有的丰富资源来为人类服务，但是实践表明，新开发的高效菌应用于染料废水的处理时，并不一定能够完全达到预期的强化作用。此外，微生物本身还存在着安全性问题，高效菌与基因工程菌流落到自然环境中，可能对自然环境和生态平衡造成威胁，因而，这些生物方法的应用必须事先经过严格的环境安全性检查和评估。同时，微生物对染料的降解机理以及微生物的代谢机制还需要进一步研究和探讨。
2．3物化一生物联合法
单一的物化法和生物法处理染料废水，虽然都有各自的优势，但也都存在局限性。于是，不少学者和工程技术人员开始尝试将物化法和生物法联合起来，通过优势互补，取长补短，取得了非常好的处理效果。
肖羽堂等人将好氧处理中的原曝气池改为生物铁屑反应池，使脱色率由原来的l5％～25％提高到90％以上，COD去除率也由原来的20％～30％提高到9O％。针对毛巾厂废水水量不大、有机污染物含量高、浓度波动范围宽、碱度较大、色度深和可生化性较差的水质特点，许玉东采用厌氧折流板反应池一生物接触氧化池一混凝沉淀一砂滤池联合处理工艺对染料废水进行处理后，出水水质可达行业排放一级标准。卢平等人立足于传统的染料废水处理工艺，采用水解酸化一接触氧化法联合技术对染料废水进行处理，研究结果表明，联合处理方法工艺结构简单，对废水的处理效果明显，出水水质稳定。Khattri等人应用物理化学法与生物处理方法相结合的原理，利用生物吸附剂对结晶紫罗兰、亚甲基蓝、孔雀绿、若丹明B等染料废水进行了处理，取得了良好效果。Walker等人将一种假单胞菌固定在粒状活性炭上处理含酸性染料的废水的联合处理效果较单一使用活性炭大大提高。
3染料废水处理的研究趋势
综上所述，国内外对有机染料废水的处理方法虽然很多，但各种方法都存在自身的局限性，不是处理效果欠佳，就是运行成本过高，或是对废水的处理有选择性。物化处理法都是利用化学试剂或电能对染料废水进行处理，存在着对有机物的去除效率不高、对染料的选择性强、处理费用高、运行不经济、产生大量难处理的污泥、容易导致二次污染等缺点，推广应用受到很大限制。生物处理法是当今广泛使用的染料废水处理方法，具有操作过程简单、运行费用低廉、不会产生二次污染、对环境友好等优势，在染料废水的处理中越来越受到重视。但由于染料废水可生化性较差，单一运用生物法己不能满足工业实际的需要。而且传统的生物处理法大多是利用微生物对有机物的生物吸附及生物降解作用，反应过程过于缓慢，对染料废水的处理周期过长，处理效率低下。此外，利用生物法处理染料废水时，由于微生物对pH值、营养物质、温度等条件有一定的要求，难以适应染料废水染料种类多、水质波动大、毒性高的特点，同时还存在占地面积大、管理复杂、对色度和COD去除率低、废水达标难度较大的缺点，还有待做大量的深入研究工作。因而，染料废水处理技术的主要发展方向是：立足于生产实际，针对染料废水的水质特点，结合微生物与物理化学处理技术，研究开发低毒、低能耗、高效、不产生二次污染的水处理技术，特别是电、光、磁、声、生物氧化、无毒药剂氧化等各种方法进行合理联用的新型水处理技术，如微生物的高效化及固定化等生物强化技术、各种生化技术。根据具体条件和相关要求，对各种有效的处理方法进行优选，不断提高处理效率，优先利用自然界中丰富的再生资源，比如太阳光、微生物等，降低染料废水的处理成本。
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