实践证明，单纯的酶制剂并不能满足纺织印染加工的工艺要求，在酶的使用过程中既要加入稳定剂来减缓酶由于使用环境的变化而带来的不稳定，同时还要配合使用纺织助剂来增益处理效果。酶制剂的复配既可以是单种类酶制剂与其他助剂的复配也可以是多种类酶制剂以及其他试剂的配合使用。
2.1单种类酶制剂的复配
事实上，多种种类的酶的复配由于受到适用的pH范围差异过大等因素影响而变得异常困难，所以很多情况下是单种类酶的复配更为常见和有实用价值。以常用的纤维素酶、淀粉酶、果胶酶来介绍单种类酶制剂的复配。
2.1.1纤维素酶的复配
纤维素酶在棉织物生物抛光或者牛仔布酶水洗方面的应用潜力巨大，但单纯的纤维素酶并不能达到良好的处理效果，纤维素酶与纺织助剂以及酶保护剂的复配能很好的提高纤维素酶的应用效果。KumarAkhil等在对纤维素纤维用于酶水洗的研究中推测内在的纤维素酶作用机理是内切葡聚酶通过主要进攻起源于纤维素纤维的无定形区来削弱松散表面形态的纤维，而不是主要降解纤维素[17]。可见纤维素酶复配时需要特别关注复配添加物对于内切葡聚酶的影响。江南大学周洪等研究了纤维素酶复配时相关助剂对酶活力的影响表明，对于酸性纤维素酶而言，包括脂肪醇聚氧乙烯醚化合物、PVP系列化合物、聚醇类表面活性剂、金属氯化物都能促进该酶的酶活，而对中性的纤维素酶则无明显的效果[18]。文飞等对复配纤维素酶组分的研究则指出，山梨醇、苯甲酸钠、氯化钠在合适的浓度条件下能促进纤维素酶的酶活[19]。吕景春等的研究表明，纤维素酶APL与山梨醇、氯化钠、脂肪醇聚氧乙烯醚以及苯甲酸钠的复配产品在生物抛光效果上优于单一的纤维素酶APL的作用[20]。
2.1.2淀粉酶的复配
淀粉酶是纺织中最早使用的工业酶制剂，广泛应用于淀粉浆料的退浆。淀粉酶的复配如前文稳定剂章节中所提到的，主要是加入稳定剂以促成淀粉酶制剂能在较高温度条件下保持较高的酶活。当然随着中温型淀粉酶和高温型淀粉酶的出现，在酶退浆工艺中有了更多的选择。
在我国华北地区经常使用淀粉与PVA浆的混合浆料进行织物上浆，这就给单纯的淀粉酶退浆带来困难，寻求淀粉酶与PVA降解酶的配合使用是当前研究的重点课题之一[1]。
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