大豆蛋白质纤维的分子结构中有多种吸色性能好的极性基团，可显色出介于蛋白质纤维与化学纤维之间的染色性能，适用染色的染料范围较广泛。尤其是采用活性染料染色，产品颜色鲜艳而有光泽，同时其耐日晒牢度、耐汗渍牢度也非常好，与蚕丝产品相比有很好的染色鲜艳度与染色牢度。
但是，在染整加工时要特别控制湿热和碱液处理条件。大豆蛋白质纤维本身易泛黄，纤维呈米黄色，且较难漂白，在100℃以上的水浴中收缩较大，这和聚乙烯醇纤维类似。
从理论上分析，大豆蛋白质纤维可以用酸性、直接、活性和中性等染料染色，但染料上染率相对较低，而且颜色鲜艳性、提升陸及湿处理牢度较差。因为酸性和活性染料主要和蛋白质结合，而纤维蛋白质含量仅25％左右，也被PVA包围和隔离，同时蛋白质在提取时多次受到化学作用，可以和染料结合的一NH2等基团不断减少，所以上染率相对较低，另外，直接染料和中性染料虽然可以上染蛋白质和PVA两种组成，但湿处理牢度不够理想。因此适用于该纤维染色的染料、助剂和工艺还有待进一步研究和开发。
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